Bioinformatic Search and Experimental Validation for the Novel Metastasis-Related Genes in Breast and Lung Cancer

View Statistics Email Alert RSS Feed

Information

Details

Project title

Code/計畫編號

NSC93-2113-M019-001

Translated Name/計畫中文名

利用生物資訊方法尋找乳癌與肺癌新的癌轉移基因及其實驗驗證

Project Coordinator/計畫主持人

Wen-Shyong Tzou

Funding Organization/主管機關

National Science and Technology Council

Co-Investigator(s)/共同執行人

鄭添祿
王記慧
于昌永
陳炳宏

Department/Unit

Department of Bioscience and Biotechnology

Website

https://www.grb.gov.tw/search/planDetail?id=981150

Year

2004

Start date/計畫起

01-08-2004

Expected Completion/計畫迄

31-07-2005

Bugetid/研究經費

465千元

ResearchField/研究領域

生物技術(醫)

" 癌症是台灣十大死因之首，而癌轉移乃是造成癌症治療困難與病患死亡的主要原因。癌轉移的分子機制仍未完全清楚確認，而最近分子基因學的研究顯示基因變異及不正常的基因表現在癌轉移扮演重要角色。在癌轉移的研究中，基因表現型晶片常被用來發掘癌轉移組織的不正常基因表現，藉以探究癌轉移的分子機制。表現型晶片的缺點之一為在晶片靈敏度可察覺的範圍內，大多僅能探測在癌轉移生物途徑中居下游的基因，而無法探測只有微小表現差異的上游?控制者?基因；如果無法解決此困難，將會使得在晶片資料解讀時遭遇很多漏洞，而欲藉由基因表現資料來建構實驗假說就會非常困難。本研究設計一種計算方法，可以解決此問題。此方法蒐集已知基因表現晶片所顯現出與癌轉移有關的基因，運用這些基因的上源調控序列尋找其他接受類似轉錄因子調控的基因，經由人類基因體33 億鹼基對搜尋，將會尋找到晶片其他未探測到的癌轉移相關基因。本計算方法的初步結果已顯現出傑出的預測能力。接下來Northern blot 將會在高轉移乳癌與肺癌細胞株證實這些基因與癌轉移的相關性。本研究也會將上述已驗證與癌轉移相關的基因群，轉染至非轉移性癌細胞株來探測在體外是否會增加其轉移性，並使用這些不同表現的基因探究癌轉移的分子機制。此研究不但結合DNA 表現晶片資料與轉錄因子的基因體搜尋，為癌轉移的分子機制提供一研究基礎，並利用乳癌及肺癌細胞株模型提供一操作平台，作為驗證與反覆修正生物資訊所建立的實驗假說。 "

DSpace CRIS

Bioinformatic Search and Experimental Validation for the Novel Metastasis-Related Genes in Breast and Lung Cancer

Details

Description