Module-Detection on Protein-Protein Interaction Network Annotated by a Symmetry-Breaking Representation

View Statistics Email Alert RSS Feed

Information

Details

Project title

Code/計畫編號

NSC94-2118-M019-001

Translated Name/計畫中文名

經破壞性對稱標註的蛋白質交互作用網路的模組探測

Project Coordinator/計畫主持人

Wen-Shyong Tzou

Funding Organization/主管機關

National Science and Technology Council

Co-Investigator(s)/共同執行人

李偉柏

Department/Unit

College of Life Sciences

Website

https://www.grb.gov.tw/search/planDetail?id=1094211

Year

2005

Start date/計畫起

01-08-2005

Expected Completion/計畫迄

31-07-2006

Bugetid/研究經費

495千元

ResearchField/研究領域

數學

" 高效率的生物技術產生了大量的資料，蛋白質交互作用資料即是一例。蛋白質交互作用網路的研究顯示出網路的近程與遠程結構特性，但是卻無法擷取功能性資料，其中有一個因素就是蛋白質交互作用的網路表示法，目前都用雙向連結。在上一個研究中本研究室導入GO(Gene Ontology)的表示法，藉以破壞蛋白質交互作用表示法的對稱性。由此種演算法我們發現某些具有特殊GO組成的network motif（由3或4 nodes 所組成的常見圖案）有極高的演化保留性質。網路結構可以用三個階層來說明，network motif-module-network，而network motif就是零件，module就是模組，本研究的目的在於設計演算法在網路中發掘module結構，並探討network motif如何組成module。此研究對於蛋白質交互作用網路是非常重要的，不但可以瞭解網路的階層性結構，也可以得知不同階層的生物功能。 "

DSpace CRIS

Module-Detection on Protein-Protein Interaction Network Annotated by a Symmetry-Breaking Representation

Details

Description