從分子演化及系統生物學角度探討胚胎發育時期低氧細胞訊息路徑的功能與調控機制---以生物資訊與蛋白質體學研究---子計畫一:研究斑馬魚胚胎發育時期低氧誘發因子抑制因子(FIH)的下游反應蛋白質基質與HIF訊息傳遞的關連性

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簡歷

基本資料

Code/計畫編號

NSC99-2627-B019-006

Translated Name/計畫中文名

從分子演化及系統生物學角度探討胚胎發育時期低氧細胞訊息路徑的功能與調控機制---以生物資訊與蛋白質體學研究---子計畫一:研究斑馬魚胚胎發育時期低氧誘發因子抑制因子(FIH)的下游反應蛋白質基質與HIF訊息傳遞的關連性

Project Coordinator/計畫主持人

Han-Jia Lin

Funding Organization/主管機關

National Science and Technology Council

Department/Unit

Department of Bioscience and Biotechnology

Website

https://www.grb.gov.tw/search/planDetail?id=2153297

Year

2010

Start date/計畫起

01-08-2010

Expected Completion/計畫迄

01-07-2011

Bugetid/研究經費

1500千元

ResearchField/研究領域

生物技術(理)
生物科學

本子計劃擬應用生化學與蛋白質體學的技術來探討斑馬魚胚胎發育過程中，氧依賴型氫氧酶 PHD 與 FIH 在 HIFα 訊息傳遞機制中所扮演之角色。本實驗室從 PHD 與 FIH 的生化特性探討開始，瞭解各物種的氧依賴型氫氧酶的異購酶之間在催化特性與基質選擇性的異同。相關的研究在人類系統已有多年基礎，但是到目前為止，科學界對於斑馬魚、海膽與文昌魚等動物之 PHD 與 FIH 的特性所知不多。由初步序列比對顯示斑馬魚有三種 HIF-α、三種 HIF-α-like 以及四種 PHD 基因存在，而海膽則有兩種 HIF-α、兩種 PHD 及一種 FIH 基因存在。由於演化上的差異，僅從序列比對並無法確定在這些動物中的 PHD 與 FIH 對於哪一種 HIF-α 具有真正的作用關係。為了建立正確的 HIF 上游調控網絡，本實驗室利用酵素學與蛋白質體學的方法去瞭解各種 PHD 與 FIH 的基質選擇偏好，同時這些酵素特性的研究也將提供其它重要的訊息。由於 PHD 與 FIH 的活性受到氧氣、鐵離子與 2-OG (2-oxoglutatate) 濃度的影響，從酵素動力學的研究也將可以深入瞭解這些酵素在哪種環境下會有較大的活性變化，例如：水生動物所處的環境中 2 氧氣濃度與陸生動物有很大的差異，因此 PHD 與 FIH 對於氧氣的親和力可能會有所差異，而這些酵素特性的探討對於瞭解整個調控網絡非常重要。

Keyword(s)

低氧誘導轉錄因子
缺氧
天門冬胺酸氫氧
脯胺酸氫氧
hypoxia inducible factor
hypoxia
Factor inhibiting hif
Propyl hydroxylase

DSpace CRIS

從分子演化及系統生物學角度探討胚胎發育時期低氧細胞訊息路徑的功能與調控機制---以生物資訊與蛋白質體學研究---子計畫一:研究斑馬魚胚胎發育時期低氧誘發因子抑制因子(FIH)的下游反應蛋白質基質與HIF訊息傳遞的關連性

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